응용분야

Advanta RNA-Seq XT NGS Library Prep Kits

Transform your RNA sequencing productivity

Advanta™ RNA-Seq NGS Library Prep Kit together with the Juno™ system provides an integrated solution for automated, cost-efficient NGS library prep.

 

Advanta RNA-Seq XT NGS Library Prep Kits

Features nanoscale automation을 통한 RNA sequencing 생산성 향상

RNA sequencing (RNA-seq)은 transcriptome 의 hypothesis-free profiling 의 표준이며, 분자생물학 실험실에서 필수적입니다. 증가하는 샘플 량의 처리를 위해, 자동화된 microfluidics 기반의 library prep은 실험 방법을 효율화하고 많은 비용을 줄임으로써 transcriptomics를 발전시킬 수 있습니다.

Fluidigm은 자동화된 RNA-seq library preparation 을 위해 microfluidics 기반 플랫폼을 개발했습니다. Juno™ 및 48.Atlas™ integrated fluidic circuit (IFC)의 활용으로, 장비를 한번 클릭하는 것으로 최대 48개의 total RNA 샘플의 동시 처리가 가능합니다. 새롭게 출시한 Advanta™ RNA-Seq XT Library Prep Kits 은 NovaSeq™ 플랫폼에 사용하기에 이상적인 unique dual indexes (UDI) adapters 를 포함하여 제품을 업데이트했으며, 시약 사용을 간소화하여 hands-on time 과 비용을 더욱 절감하였습니다.

The Advanta RNA-Seq XT Kits 는 48.Atlas IFCs (4 per kit), 시약, Control Line Fluid, total RNA 샘플 192개에서 라이브러리를 생성하기 위한 UDI adapters, 1–48 UDI 바코드(PN 101-9950) 4세트 또는 1–48 UDI 바코드 2세트 및 49–96 UDI 바코드(PN 101-9959) 2세트 중 하나로 구성되어 있습니다.

Workflow

Advanta RNA-Seq XT 는 48.Atlas IFC 및 Juno를 통해 매우 효율적인 실험이 가능합니다.

Advanta RNA-Seq XT Kits 에는 library preparation 시약, UDI adapters 및 표준 96-well plate 와 거의 동일한 크기와 모양을 가진 미세 유체 장치인 48.Atlas IFC 가 포함됩니다. 샘플과 시약 혼합물은 IFC로 주입되며, IFC는 대부분 단계의 자동 처리를 위해 Juno system 에 배치됩니다. Juno 에서의 실험 과정은 수동 단계와 피펫팅이 필요 없기 때문에 소모품 비용과 플라스틱 폐기물은 물론 실제 작업 시간도 크게 단축됩니다.

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Highlights 48.Atlas IFC format enables true walkaway automation

The 48.Atlas IFC architecture automates multiple workflow steps otherwise performed manually, including poly(A) RNA capture, RNA fragmentation, reverse-transcription, sample-barcode PCR and multiple wash steps.

Workflow comparison

See example comparing hands-on time and number of manual processing steps for several RNA-seq workflows. Comparisons were made between the Advanta RNA-Seq XT NGS Library Prep Kit and TruSeq® Stranded mRNA LP, NEBNext® Ultra II Directional RNA LP and KAPA mRNA HyperPrep LP. All workflows include quantification of 48 samples by qPCR and pooling to obtain the final library for sequencing. The Advanta RNA-Seq XT workflow using the 48.Atlas IFC with Juno system automation enables substantial hands-on time savings relative to the alternative library prep workflows.

Performance

분석 유효성 검사 테스트에서 생성된 성능 결과 요약.

Performance characteristics of the Advanta RNA-Seq XT Kit (PN 101-9959) on Juno were assessed in an analytical validation study. Total RNA samples were Universal Human Reference RNA (UHRR; Agilent®) and human adult brain RNA (Brain; BioChain®). The results demonstrate high mapping statistics with a low-percentage reads mapping to rRNA sequences for both RNA types and input amounts of either 10 ng or 100 ng.

Advanta RNA-Seq NGS Library Prep Kit Flyer App Note - Advanta RNA-Seq NGS Library Prep 더 알아보기

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